Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms