Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIOK2Q9BVS4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms