Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LINC00208Q96KT6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms