Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC1Q9Y5R8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms