Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
THUMPD2Q9BTF0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms