Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM43BQ6ZT52 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms