Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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