Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATP2C1P98194 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms