Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEFHP12036 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms