Protein–RNA interactions for Protein: Q99643

SDHC, Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHCQ99643 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDHCQ99643 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms