Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUCB1Q02818 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUCB1Q02818 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms