Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11FIP3O75154 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11FIP3O75154 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms