Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNNA3Q9UI47 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms