Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTDSP1Q9GZU7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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CTDSP1Q9GZU7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CTDSP1Q9GZU7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CTDSP1Q9GZU7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTDSP1Q9GZU7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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