Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COPS8Q99627 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COPS8Q99627 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms