Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms