Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF354BQ96LW1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms