Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCOA1Q15788 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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NCOA1Q15788 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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NCOA1Q15788 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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NCOA1Q15788 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCOA1Q15788 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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