Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRDNQ13061 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRDNQ13061 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRDNQ13061 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRDNQ13061 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRDNQ13061 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRDNQ13061 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRDNQ13061 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRDNQ13061 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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