Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms