Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SNHG12Q9BXW3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms