Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GAPVD1Q14C86 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
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