Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA52P62987 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA52P62987 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA52P62987 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA52P62987 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA52P62987 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA52P62987 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBA52P62987 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms