Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGDP52209 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGDP52209 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGDP52209 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms