Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PTGDSP41222 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms