Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKAB2O43741 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms