Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UBXN6Q9BZV1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UBXN6Q9BZV1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms