Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSBN1Q5VWQ0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms