Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TPRNQ4KMQ1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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