Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP4F3Q08477 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP4F3Q08477 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms