Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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NDUFS5O43920 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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NDUFS5O43920 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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NDUFS5O43920 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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NDUFS5O43920 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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NDUFS5O43920 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
NDUFS5O43920 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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