Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFS5O43920 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFS5O43920 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NDUFS5O43920 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFS5O43920 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFS5O43920 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NDUFS5O43920 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NDUFS5O43920 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NDUFS5O43920 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDUFS5O43920 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NDUFS5O43920 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NDUFS5O43920 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFS5O43920 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFS5O43920 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFS5O43920 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFS5O43920 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFS5O43920 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NDUFS5O43920 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NDUFS5O43920 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NDUFS5O43920 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NDUFS5O43920 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDUFS5O43920 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDUFS5O43920 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDUFS5O43920 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDUFS5O43920 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFS5O43920 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFS5O43920 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFS5O43920 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFS5O43920 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFS5O43920 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFS5O43920 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFS5O43920 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFS5O43920 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDUFS5O43920 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDUFS5O43920 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NDUFS5O43920 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDUFS5O43920 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDUFS5O43920 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFS5O43920 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDUFS5O43920 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDUFS5O43920 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NDUFS5O43920 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFS5O43920 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFS5O43920 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NDUFS5O43920 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFS5O43920 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFS5O43920 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFS5O43920 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFS5O43920 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFS5O43920 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFS5O43920 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFS5O43920 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFS5O43920 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFS5O43920 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFS5O43920 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFS5O43920 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFS5O43920 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFS5O43920 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFS5O43920 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFS5O43920 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFS5O43920 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFS5O43920 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFS5O43920 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFS5O43920 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFS5O43920 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFS5O43920 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFS5O43920 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFS5O43920 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NDUFS5O43920 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NDUFS5O43920 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFS5O43920 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NDUFS5O43920 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFS5O43920 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFS5O43920 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFS5O43920 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFS5O43920 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFS5O43920 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFS5O43920 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFS5O43920 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFS5O43920 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFS5O43920 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFS5O43920 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFS5O43920 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDUFS5O43920 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFS5O43920 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFS5O43920 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NDUFS5O43920 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NDUFS5O43920 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDUFS5O43920 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDUFS5O43920 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDUFS5O43920 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFS5O43920 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDUFS5O43920 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDUFS5O43920 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms