Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYH13Q9UKX3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYH13Q9UKX3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms