Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms