Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PXDC1Q5TGL8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PXDC1Q5TGL8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms