Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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NR1H3Q13133 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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NR1H3Q13133 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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NR1H3Q13133 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NR1H3Q13133 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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