Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NFX1Q12986 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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