Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNMT3AQ9Y6K1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNMT3AQ9Y6K1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNMT3AQ9Y6K1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DNMT3AQ9Y6K1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms