Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCYT1BQ9Y5K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCYT1BQ9Y5K3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCYT1BQ9Y5K3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms