Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
WASHC2CQ9Y4E1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
WASHC2CQ9Y4E1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
WASHC2CQ9Y4E1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
WASHC2CQ9Y4E1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
WASHC2CQ9Y4E1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms