Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CAB39Q9Y376 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAB39Q9Y376 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAB39Q9Y376 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAB39Q9Y376 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms