Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FZD1Q9UP38 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FZD1Q9UP38 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FZD1Q9UP38 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FZD1Q9UP38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FZD1Q9UP38 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms