Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNW9

NOVA2, RNA-binding protein Nova-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA2Q9UNW9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOVA2Q9UNW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NOVA2Q9UNW9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOVA2Q9UNW9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOVA2Q9UNW9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms