Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNW9

NOVA2, RNA-binding protein Nova-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA2Q9UNW9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NOVA2Q9UNW9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NOVA2Q9UNW9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NOVA2Q9UNW9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NOVA2Q9UNW9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NOVA2Q9UNW9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NOVA2Q9UNW9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NOVA2Q9UNW9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NOVA2Q9UNW9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NOVA2Q9UNW9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NOVA2Q9UNW9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NOVA2Q9UNW9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NOVA2Q9UNW9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NOVA2Q9UNW9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NOVA2Q9UNW9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NOVA2Q9UNW9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NOVA2Q9UNW9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NOVA2Q9UNW9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NOVA2Q9UNW9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NOVA2Q9UNW9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NOVA2Q9UNW9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NOVA2Q9UNW9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NOVA2Q9UNW9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NOVA2Q9UNW9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NOVA2Q9UNW9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NOVA2Q9UNW9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NOVA2Q9UNW9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NOVA2Q9UNW9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NOVA2Q9UNW9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NOVA2Q9UNW9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NOVA2Q9UNW9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NOVA2Q9UNW9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NOVA2Q9UNW9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NOVA2Q9UNW9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NOVA2Q9UNW9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NOVA2Q9UNW9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NOVA2Q9UNW9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NOVA2Q9UNW9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NOVA2Q9UNW9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOVA2Q9UNW9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOVA2Q9UNW9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOVA2Q9UNW9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOVA2Q9UNW9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NOVA2Q9UNW9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOVA2Q9UNW9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NOVA2Q9UNW9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NOVA2Q9UNW9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NOVA2Q9UNW9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NOVA2Q9UNW9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NOVA2Q9UNW9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NOVA2Q9UNW9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NOVA2Q9UNW9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOVA2Q9UNW9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOVA2Q9UNW9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NOVA2Q9UNW9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NOVA2Q9UNW9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NOVA2Q9UNW9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOVA2Q9UNW9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NOVA2Q9UNW9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NOVA2Q9UNW9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NOVA2Q9UNW9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NOVA2Q9UNW9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NOVA2Q9UNW9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NOVA2Q9UNW9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NOVA2Q9UNW9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NOVA2Q9UNW9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NOVA2Q9UNW9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NOVA2Q9UNW9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOVA2Q9UNW9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOVA2Q9UNW9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NOVA2Q9UNW9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOVA2Q9UNW9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NOVA2Q9UNW9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOVA2Q9UNW9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOVA2Q9UNW9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOVA2Q9UNW9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NOVA2Q9UNW9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOVA2Q9UNW9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NOVA2Q9UNW9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOVA2Q9UNW9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOVA2Q9UNW9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NOVA2Q9UNW9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NOVA2Q9UNW9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NOVA2Q9UNW9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NOVA2Q9UNW9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOVA2Q9UNW9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NOVA2Q9UNW9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NOVA2Q9UNW9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NOVA2Q9UNW9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NOVA2Q9UNW9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NOVA2Q9UNW9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NOVA2Q9UNW9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms