Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCC3Q9ULS5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCC3Q9ULS5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms