Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HDAC9Q9UKV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HDAC9Q9UKV0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC9Q9UKV0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC9Q9UKV0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms