Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CPA4Q9UI42 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CPA4Q9UI42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPA4Q9UI42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CPA4Q9UI42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPA4Q9UI42 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPA4Q9UI42 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPA4Q9UI42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPA4Q9UI42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms