Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRPS1Q9UHF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRPS1Q9UHF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRPS1Q9UHF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms