Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL42Q9P2K6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL42Q9P2K6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL42Q9P2K6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms