Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU1

FLRT1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT1Q9NZU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLRT1Q9NZU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FLRT1Q9NZU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLRT1Q9NZU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLRT1Q9NZU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms